Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.3 ms