Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

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Length 3,267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPEGQ15772 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms