Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms