Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms