Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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BRD3Q15059 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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