Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMCO1Q147U7 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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