Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL9A3Q14050 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms