Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms