Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHROOM2Q13796 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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