Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APOFQ13790 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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