Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAPSNQ13702 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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