Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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