Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4BQ13620 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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