Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PEX6Q13608 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PEX6Q13608 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PEX6Q13608 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PEX6Q13608 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PEX6Q13608 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PEX6Q13608 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PEX6Q13608 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PEX6Q13608 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PEX6Q13608 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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