Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms