Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TRAF2Q12933 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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