Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COX10Q12887 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COX10Q12887 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COX10Q12887 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COX10Q12887 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms