Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms