Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RBBP4Q09028 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms