Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA3Q08378 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms