Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
REG3AQ06141 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms