Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms