Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms