Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms