Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms