Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms