Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2BQ00403 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms