Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms