Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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