Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms