Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VSX2P58304 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSX2P58304 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSX2P58304 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms