Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP1S2P56377 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms