Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms