Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPAP53621 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPAP53621 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPAP53621 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPAP53621 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms