Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA4P51532 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms