Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms