Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms