Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP1P29466 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP1P29466 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP1P29466 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP1P29466 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP1P29466 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP1P29466 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms