Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCAP28676 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCAP28676 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCAP28676 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCAP28676 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCAP28676 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GCAP28676 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCAP28676 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCAP28676 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCAP28676 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCAP28676 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCAP28676 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms