Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCHP24723 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRKCHP24723 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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