Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD247P20963 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD247P20963 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD247P20963 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD247P20963 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD247P20963 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD247P20963 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD247P20963 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD247P20963 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD247P20963 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms