Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRHP20396 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRHP20396 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRHP20396 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRHP20396 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms