Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms