Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF3P18847 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF3P18847 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATF3P18847 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATF3P18847 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATF3P18847 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATF3P18847 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF3P18847 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms