Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VCLP18206 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VCLP18206 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VCLP18206 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms