Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADSP16219 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADSP16219 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADSP16219 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADSP16219 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACADSP16219 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACADSP16219 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSP16219 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSP16219 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSP16219 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSP16219 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSP16219 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms