Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAV1P15498 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAV1P15498 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAV1P15498 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAV1P15498 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAV1P15498 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAV1P15498 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAV1P15498 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAV1P15498 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAV1P15498 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms