Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNAP12004 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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