Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNB1P11230 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms