Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHGAP10645 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHGAP10645 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHGAP10645 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms